Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG3Q9NT62 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms