Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms