Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB18Q9NP72 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms