Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP29Q9HBJ7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP29Q9HBJ7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP29Q9HBJ7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP29Q9HBJ7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP29Q9HBJ7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP29Q9HBJ7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP29Q9HBJ7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP29Q9HBJ7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms