Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEBOXQ9HB31 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms