Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTD2Q9H8S5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD2Q9H8S5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms