Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00597Q9H2U6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms