Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms