Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLIRPQ9GZT3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms