Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms