Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms