Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms