Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms