Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms