Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNPPD1Q9BV87 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms