Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFHD1Q9BUP0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms