Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT17Q9BSW7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT17Q9BSW7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms