Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCM2Q9BSQ5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCM2Q9BSQ5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms