Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms