Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPA33Q99795 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms