Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms