Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms