Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms