Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms