Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ARXQ96QS3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARXQ96QS3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms