Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD27Q96NW4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD27Q96NW4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms