Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms