Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL15Q96M94 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL15Q96M94 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms