Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX22Q96L94 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms