Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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