Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms