Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4CQ96DT6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms