Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C18orf8Q96DM3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms