Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRSK1Q8TDC3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms