Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms