Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DTX3Q8N9I9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms