Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF1Q8N6C5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms