Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD4Q8N4Q1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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