Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms