Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms