Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms