Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2Q1Q7Z7E8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2Q1Q7Z7E8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2Q1Q7Z7E8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2Q1Q7Z7E8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms