Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PKD1L3Q7Z443 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD1L3Q7Z443 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms