Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDPD3Q7L5L3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms