Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms