Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PREX2Q70Z35 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PREX2Q70Z35 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms