Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms