Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFHC1Q5JVL4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFHC1Q5JVL4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms