Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms