Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LACTB2Q53H82 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LACTB2Q53H82 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms